El templo que había a finales del siglo X fue destruido durante el ataque de Al-Mansur Ibn Abi Aamir (comandante del califa de Córdoba), aunque las reliquias de los santos fueron dejadas intactas. A finales del siglo XI comenzó a levantarse la catedral, ampliada a lo largo de los siglos. La más reciente intervención, terminada en 2021, ha sido la restauración del Pórtico de la Gloria, obra del maestro italiano Mateo, bajo encargo del rey Fernando II de León, entre finales del siglo XII y comienzos del XIII. La catedral fue consagrada en 1211.
El año 2021 fue declarado Año Santo (Jacobeo o Jubilar) en la catedral española de Santiago de Compostela, al caer en domingo la fecha de la solemnidad del apóstol (25 de julio), la vez número 120 desde que se registra el evento. Debido a la pandemia del coronavirus, las autoridades eclesiásticas extendieron el jubileo hasta 2022, como un voto también de esperanza de alivio para el mundo.